Cho đến nay, hơn 200 peptide kháng khuẩn đã được phân lập từ nhiều sinh vật khác nhau, trong đó có hơn 170 loại có nguồn gốc từ côn trùng. Các peptide này được phân loại dựa trên nguồn gốc và đặc tính cấu trúc của chúng.
Peptide tuyến tính có cấu trúc xoắn ốc
Cecropin là peptide kháng khuẩn động vật đầu tiên được phát hiện; chúng được phân lập từ nhộng của bướm tằm Mỹ (*Hyalophora cecropia*) bởi Boman et al. vào năm 1980.
Peptide tuyến tính giàu axit amin cụ thể
Apidaecin là kháng sinh giàu peptide-proline được phân lập từ ong mật. Chúng thường bao gồm 16–18 dư lượng axit amin, với hàm lượng proline lên tới 33% và hàm lượng arginine lên tới 17%. Apidaecin có hoạt tính mạnh chống lại một số vi khuẩn Gram-âm nhất định nhưng không hiệu quả đối với vi khuẩn Gram-dương.
Peptide chứa một liên kết disulfide đơn
Đây là một loại peptide kháng khuẩn nhỏ. Peptide đầu tiên thuộc loại này được phát hiện là bactenecin, có nguồn gốc từ bạch cầu trung tính của bò. Nó chứa 12 axit amin-bao gồm bốn gốc arginine-và tạo thành liên kết disulfua giữa gốc thứ hai và thứ mười một.
Peptide chứa hai hoặc nhiều liên kết disulfide
Defensin là đại diện nguyên mẫu của lớp này. Các -defensin được phát hiện ban đầu, có nguồn gốc từ mô của động vật có vú, thường chứa 29–34 dư lượng axit amin; sáu dư lượng cystein được bảo tồn tạo thành ba liên kết disulfide nội phân tử. Ngoài ra, dư lượng arginine ở vị trí 6 và 15, cũng như dư lượng glycine ở vị trí 24, được bảo toàn.
Lantibiotic
Lantibamel là kháng sinh peptide do vi khuẩn sản xuất; chúng được mã hóa di truyền, tổng hợp trên ribosome và trải qua-sự biến đổi sau dịch mã để kết hợp các nhóm hữu cơ cụ thể. Nisin được nghiên cứu rộng rãi nhất trong số đó.